本所自九十九學年度起正式由「行銷與流通管理研究所」及「運輸與物流工程研究所」整併更名，設立之初即為因應「現有國內各大學在設置研究所培育人才比例」及「產業人才需求」之現況而設立。面對全球化的競爭挑戰與轉型，台灣需要更多行銷與運籌方面的人才。
「設立宗旨」:
1.實踐高等教育理念，提供行銷與運籌之專業知識。
2.提供紮實的理論與方法課程之訓練，縮小「行銷與運籌專業人才缺口」。
3.提供行銷與運籌之專業諮詢服務，協助企業與政府解決行銷、物流與運輸之相關問題。