| 期刊論文（共計17筆） |
| 序號 | 學年度 | 學期 | 年度 | 月份 | 作者 | 題目 | 通訊作者 | 作者順位 | 期刊名稱 | 卷數 | 頁數 | 關鍵字 |
| 1 | 087 | 1 | 1999 | 1 | Kuo, C. H., S. Kao, C. F. Weng and S. C. Lee | Expression of LDH-C isozyme among lizard taxa: evolutionary implications for the vertebrate lactate dehydrogenase Gene Family. | 否 | 第一順位 | Zool. Studies | | | evolution, lactate dehydrogenase |
| 2 | 089 | 1 | 2001 | 1 | Liao, C.H., W. Z. Ho, H. W. Huang, C. H. Kuo, S. C. Lee, S. S. Li. | Lactate dehydrogenase genes of caiman and Chinese soft-shelled turtle, with emphasis on the molecular phylogenetics and evolution of reptiles | 是 | 其他 | Gene | | | lactate dehydrogenase, evolution, phylogeny |
| 3 | 089 | 1 | 2001 | 1 | Mok, H. K., C. H. Kuo. | Myxine formosana, a new species of hagfish (Myxiniformes: Myxinidae) from the southwestern waters of Taiwan. | 否 | 第二順位 | Ichthyol. Res. | | | hagfish, new species |
| 4 | 090 | 1 | 2002 | 1 | Tso, I. M., C. S. Ku, Tai, P. L., C. H. Kuo and E. C. Yang. | Population genetic structure and color-associated foraging success in a melanic spider Nephila maculata | 是 | 其他 | Animal Behaviour | | | population genetics, isozyme, genetic vaiation |
| 5 | 090 | 1 | 2002 | 1 | Kuo, C. H., S. C. Lee. | Cloning and sequencing of cDNA of the hemoglobin gene in the hagfish, Paramyxine sheni. | 否 | 第一順位 | J. Genet. Mol. Biol. | | | hagfish, evolution, phylogeny |
| 6 | 091 | 1 | 2003 | 1 | Wang, C. H., C. H. Kuo, H. K. Mok, and S. C. Lee | Molecular phylogeny of elopomorph fishes inferred from mitochondrial 12S ribosomal RNA sequences. | 是 | 第二順位 | Zool. Scripta | | | phylogeny, evolution, molecular systematics, elopomorph |
| 7 | 091 | 1 | 2003 | 1 | Kuo, C. H., S. Huang, and S. C. Lee. | Phylogeny of hagfish based on the mitochondrial 16S rRNA gene | 否 | 第一順位 | Mol. Phylogen. Evol. | | | hagfish, phylogeny |
| 8 | 096 | 2 | 2008 | 4 | Chien-Hsien Kuo | The discovery of LDH-C isozyme locus from testes of some avian taxa | 否 | 第一順位 | J. Genet. Mol. Biol. | | | L-lactate dehydrogenase (LDH), isozymes, evolution, avian |
| 9 | 096 | 2 | 2008 | 5 | Su Mei Wu , Yu Da Zheng, Chien-Hsien Kuo | Expression of mt2 and smt-B upon cadmium exposure and cold shock in
zebrafish (Danio rerio) | 是 | 第三順位 | Comparative Biochemistry and Physiology, Part C | | | Adaptation, Development, Isoform, Phylogenetic, Teleost, Transcripts |
| 10 | 097 | 1 | 2008 | 9 | Yung-Che Tseng, Jay-Ron Lee, Joshua Chia-Hsi Chang, Chien-Hsien Kuo, Shyh-Jye Lee, and Pung-Pung Hwang | Regulation of Lactate Dehydrogenase in Tilapia (Oreochromis
mossambicus) Gills during Acclimation to Salinity Challenge | 是 | 其他 | Zoological Studies | | | Lactate dehydrogenase, Energy metabolism, Tilapia gills, Salinity challenge, Osmoregulation. |
| 11 | 099 | 1 | 2010 | 10 | 張瑞宗, 郭建賢 | 台灣鯛分子鑑定平台之建立及其應用 | 否 | 第一順位 | 農業生技產業季刊 | | | |
| 12 | 099 | 1 | 2010 | 11 | CH Kuo, SC Lee, HK Mok | A new species of hagfish Eptatretus rubicundus (Myxinidae: Myxiniformes) from Taiwan, with reference to it phylogenetic position based on its Mitochondrial DNA sequence | 否 | 第一順位 | Zoological Studies | | | |
| 13 | 100 | 1 | 2011 | 9 | Tzen-Yuh Chiang, Teh-Wang Lee, Kui-Ching Hsu, Chien-Hsien Kuo, Der-Yuh Lin, Hung-Du Lin | Population structure in the endangered cyprinid fish Pararasbora moltrechti in Taiwan, based on mitochondrial and microsatellite DNAs. | 否 | 其他 | ZOOLOGICAL SCIENCE | 0 | 642-651 | mtDNA Cyt b gene, gene flow, microsatellite |
| 14 | 101 | 2 | 2013 | 6 | BO FERNHOLM, MICHAEL NOREN, SVEN O. KULLANDER, ANDREA M. UATTRINI, VINCENT ZINTZEN, CLIVE D. ROBERTS | Hagfish phylogeny and taxonomy, with description of the new genus Rubicundus (Craniata, Myxinidae) | 是 | 其他 | Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research | 51 | 296-307 | |
| 15 | 102 | 1 | 2013 | 8 | 郭建賢 | The effect of temperature on the expression of heat shock protein 70 and the activies of phosphoglucose isomerase of mullet (Mugil cephalus) larvae with different pgi-A genotype. | 是 | 其他 | Journal of the Fisheries Society of Taiwan | 40 | 205-217 | |
| 16 | 105 | 2 | 2017 | 6 | Egan JP, Chew US, Kuo CH, Villarroel-Diaz V, Hundt PJ, Iwinski NG, Hammer MP, Simons AM, | Diets and trophic guilds of small fishes from coastal marine habitats in western Taiwan | 否 | 第三順位 | J Fish Biol. | 91 | 331-345 | |
| 17 | 106 | 2 | 2018 | 3 | Egan JP, Bloom DD, Kuo CH, Hammer MP, Tongnunui P, Iglésias SP, Sheaves M, Grudpan C, Simons | Phylogenetic analysis of trophic niche evolution reveals a latitudinal herbivory gradient in Clupeoidei (herrings, anchovies, and allies). | 否 | 第三順位 | Mol Phylogenet Evol | 124 | 151-161 | |
| 會議論文（共計20筆） |
| 序號 | 學年度 | 學期 | 年度 | 月份 | 作者 | 題目 | 通訊作者 | 作者順位 | 發表性質 | 會議論文集或研討會名稱 | 地點 |
| 1 | 094 | 1 | 2005 | 10 | 賴弘智、陳哲俊、陳淑美、郭世榮、郭建賢、熊文俊 | 小盾鱧之危害分析、防治對策與宣導 | 否 | | | 台灣地區入侵水生物現况及防治策略研討會 | 嘉義 |
| 2 | 094 | 1 | 2005 | 12 | 翁紹儒、劉芝岺、賴弘智、郭建賢 | 台灣青鰣魚(Oryzias latipes)的族群遺傳結構 | 否 | | | 台灣水產學會學術論文發表會論文摘要集 | 屏東 |
| 3 | 095 | 1 | 2006 | 12 | 翁紹儒、郭建賢 | 烏魚PGI對偶基因與温度適應之生理表現 | 否 | | | 台灣水產學會學術論文發表會論文摘要集 | 基隆 |
| 4 | 094 | 2 | 2006 | 7 | 賴弘智,郭世榮,陳哲俊,陳淑美,郭建賢,熊文俊,黃健政,馮淑慧,蕭泉源,陳義雄,陳天任,施志昀,鄭文驣,黃榮富 | 外來魚種之危害分析、防治對策 | 否 | | | 台灣地區入侵水產生物現況及防治策略研討會 | 南投 |
| 5 | 096 | 1 | 2007 | 12 | 陳慧芳,陳孟仙,郭建賢 | 台灣周邊海域黑邊鰏族群遺傳結構 | 否 | | | 台灣水產學會學術論文發表會 | 高雄,台灣 |
| 6 | 096 | 1 | 2007 | 12 | 胡惠鈞,郭建賢 | 利用PCR-RFLP分析粒線體DNA片段探討台灣河口鯔科魚類仔稚魚種類. | 否 | | | 台灣水產學會學術論文發表會 | Kaohsiung, Taiwan. |
| 7 | 096 | 1 | 2007 | 12 | 劉芝岑,郭建賢 | 以斑馬魚探討不同溫度下磷酸葡萄糖異構酶基因的表現 | 是 | 第一順位 | 書面發表 | 台灣水產學會學術論文發表會 | Kaohsiung, Taiwan |
| 8 | 095 | 2 | 2007 | 6 | Shao-Ju Weng and Chien-Hsien Kuo | The physiological consequences of temperature adaptation in mullet (Mugil cephalus) with different PGI alleles | 否 | | | 2007年中華民國魚類學會論文發表會 | 台北 |
| 9 | 095 | 2 | 2007 | 6 | Chien-Hsien Kuo, Hui-Ju Ting, Shao-Ju Weng, Chien-Hong Liu and Gang-Yi Liu | Genetic diversity in farmed Nile and red hybrid tilapia stocks evaluated from microsatellite | 否 | | | 2007年中華民國魚類學會論文發表會 | 台北 |
| 10 | 095 | 2 | 2007 | 6 | Chien-Hsien Kuo and Sheau-Yun Li | Phylogenetic relationships of Mugil cephalus based on mitochondrial DNA sequence analyses in the West-Pacific Rim | 否 | | | 2007年中華民國魚類學會論文發表會 | 台北 |
| 11 | 095 | 2 | 2007 | 6 | 黃詩涵,郭建賢,陳哲俊 | 鱧科魚類Hemoglobin基因序列的分析 | 否 | | | 2007年中華民國魚類學會論文發表會 | 台北 |
| 12 | 098 | 2 | 2010 | 3 | 張瑞宗、丁惠茹、郭建賢 | 利用四組微衛星基因座探討歐利亞吳郭魚(Oreochromis aureus)、尼羅吳郭魚(O. niloticus)與台灣鯛(Taiwan tilapia)之間的差異。 | 是 | 第一順位 | 書面發表 | 魚類學會年會 | 彰化 |
| 13 | 098 | 2 | 2010 | 3 | 劉冠宏、郭建賢 | 水溫對莫三比克(Oreochromis mossambicus)仔魚在早期性別分化期間基因表現的影響。 | 是 | 第一順位 | 書面發表 | 魚類學會年會 | 彰化 |
| 14 | 101 | 1 | 2012 | 12 | 黃文謙、李宗叡、郭建賢 | 台灣野生吳郭魚之族群遺傳結構研究 | 是 | 第三順位 | 口頭發表 | 101年度水產年會暨學術論文發表會 | 基隆 |
| 15 | 101 | 1 | 2012 | 12 | 李宗叡*、陳則明、黃珮瑄、 Joyce Faler、Matt Powell、郭 建賢 | 尼羅吳郭魚(Oreochromis niloticus)血液冷處理之生理反應
| 是 | 其他 | 壁報發表 | 101年度水產年會暨學術論文發表會 | 基隆 |
| 16 | 106 | 1 | 2017 | 12 | 郭建賢 | Tilapia culture in Taiwan-A Successful Aquaculture story
| 是 | 第一順位 | 口頭發表 | 智能養殖投資與創新論壇(Smart Aquaculture Investment and Innovation Forum (SAIIF)) | 韓國首爾 |
| 17 | 108 | 1 | 2019 | 11 | 郭建賢 | 臺灣與新南向國家的海洋產業合作發展之探討 | 是 | 第一順位 | 書面發表 | 東南亞國際海洋論壇 | 高雄 |
| 18 | 108 | 1 | 2019 | 9 | 郭建賢 | 吳郭魚全雄苗之繁殖 | 是 | 第一順位 | 口頭發表 | 台灣鯛養殖與營養研討會 | 屏東 |
| 19 | 111 | 1 | 2022 | 10 | 郭建賢 | 吳郭魚產業發展相關策略與方針 | 是 | 第一順位 | 口頭發表 | 史瓦濟蘭漁業服務 | 農委會國際處會議室 |
| 20 | 112 | 2 | 2024 | 4 | 郭建賢 | 各國逐步發展基因編輯趨勢下，如何衡平我國農業永續、糧食安全及國際貿易各面向，並建議調適策略或方向。
| 否 | 其他 | 口頭發表 | 農業基因編輯國內外發展應用論壇 | 國立臺灣科技大學國際大樓 |
研究計畫（共計33筆） 備註欄說明：「教師研究計畫管理系統轉入之計畫」（係指依「國立嘉義大學產學合作計畫實施要點」第3點規定，與政府機關、法人、公民營事業機構、民間團體、學術研究機構等合作辦理有關事項，以本校名義與合作機構辦理簽約，其經費撥入本校之產學合作計畫。) |
| 序號 | 學年度 | 學期 | 年度 | 月份 | 參與性質 | 委辦單位 | 計畫名稱 | 開始日期 | 結束日期 | 經費 | 備註欄 |
| 1 | 094 | 1 | 2005 | 08 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 烏魚遺傳多樣性及演化機制之研究(3/3) | 2005/08/01 | 2006/07/31 | 1382590 | |
| 2 | 094 | 1 | 2006 | 01 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 微衛星DNA分子指標之應用 -- 臺灣鯛品系鑑定及選育 | 2006/01/01 | 2006/12/31 | 1725000 | |
| 3 | 094 | 2 | 2006 | 05 | 共同主持人 | 農業部 | 農田灌溉排水路生態工法推動與追蹤調查 | 2006/05/01 | 2006/12/10 | 1097000 | |
| 4 | 095 | 1 | 2007 | 01 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 微衛星DNA分子指標之應用 -- 臺灣鯛品系鑑定及選育 | 2007/01/01 | 2007/12/31 | 1920000 | |
| 5 | 096 | 1 | 2007 | 09 | 共同主持人 | 其他合作單位 | 嘉義縣好美里及鰲鼓溼地野生動物保護區之魚類資源調查分析 | 2007/09/17 | 2008/07/30 | 95400 | |
| 6 | 096 | 1 | 2008 | 01 | 子計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 微衛星DNA分子指標之應用 -- 臺灣鯛品系鑑定及選育 | 2008/01/01 | 2008/12/31 | 2000000 | |
| 7 | 096 | 2 | 2008 | 07 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部-「學海築夢」97年度獎助大學校院海外專業實習先導型計畫
| 2008/07/01 | 2008/09/12 | 346343 | |
| 8 | 096 | 2 | 2008 | 07 | 子計畫主持人 | 農業部 | 基因標識技術應用於吳郭魚選種 | 2008/07/16 | 2008/12/31 | 1219000 | |
| 9 | 097 | 1 | 2008 | 08 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部辦理補助海洋主題優質通識教育課程計畫 | 2008/08/01 | 2009/01/31 | 146400 | |
| 10 | 097 | 1 | 2008 | 08 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部辦理補助大學校院開設海洋相關資訊跨領域課程計畫 | 2008/08/01 | 2009/01/31 | 391500 | |
| 11 | 097 | 2 | 2009 | 04 | 子計畫主持人 | 農業部 | 水產養殖關鍵生物技術--吳郭魚苗基因劣化之改善研究 | 2009/04/01 | 2009/12/31 | 0 | |
| 12 | 098 | 1 | 2009 | 08 | 總計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 應用魚體成長快速分子標誌進行優質台灣鯛育種
| 2009/08/01 | 2010/07/31 | 100000 | |
| 13 | 098 | 1 | 2009 | 08 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部-「學海築夢」99年度獎助大學校院海外專業實習先導型計畫
| 2009/08/01 | 2011/10/31 | 150000 | |
| 14 | 098 | 1 | 2009 | 08 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部辦理補助大學校院開設海洋相關資訊跨領域課程計畫--海洋生物保育課程 | 2009/08/01 | 2010/07/31 | 280545 | |
| 15 | 099 | 1 | 2010 | 08 | 總計畫主持人 | 教育部 | 教育部辦理補助大學校院開設海洋相關資訊跨領域課程計畫--海洋種苗培育主題結構性組合課程 | 2010/08/01 | 2011/07/31 | 476700 | |
| 16 | 100 | 1 | 2011 | 08 | 計畫主持人 | 教育部 | 大學校院開設海洋主題導向專業及通識課程計畫--海洋種苗培育主題結構性組合課程 | 2011/08/01 | 2012/01/31 | 592358 | |
| 17 | 100 | 1 | 2011 | 08 | 計畫主持人 | 教育部 | 海洋教育先導型計畫--培育教師海洋知能及教材發展計畫:海洋通識結構性課程 | 2011/08/01 | 2012/07/31 | 1433800 | |
| 18 | 100 | 2 | 2012 | 06 | 計畫主持人 | 教育部 | 美國國家魚類繁殖中心實習計畫 | 2012/06/01 | 2013/12/31 | 224688 | |
| 19 | 100 | 2 | 2012 | 06 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 產學合作計畫-台灣鯛核心群育種計畫-〈子計畫二〉台灣鯛遺傳管理與YY品系之建立(1/2) | 2012/06/01 | 2013/05/31 | 1286600 | |
| 20 | 101 | 2 | 2013 | 03 | 計畫主持人 | 其他政府機關-其他政府單位 | 高山溪流水生生物資料建立 | 2013/03/01 | 2013/12/31 | 437986 | |
| 21 | 101 | 2 | 2013 | 06 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 台灣鯛核心群育種計畫-〈子計畫二〉台灣鯛遺傳管理與YY品系之建立(2/2) | 2013/06/01 | 2013/12/31 | 613000 | |
| 22 | 101 | 2 | 2013 | 06 | 計畫主持人 | 國家科學及技術委員會 | 產學合作計畫-台灣鯛核心群育種計畫-〈子計畫二〉台灣鯛遺傳管理與YY品系之建立(2/2) | 2013/06/01 | 2013/12/31 | 613000 | 教師研究計畫管理系統轉入之計畫 |
| 23 | 103 | 1 | 2014 | 10 | 計畫主持人 | 其他民間企業團體-其他民間企業團體或個人 | 英華威風力發電集團之風力發電機組營運產生振動、炫影對烏魚影響評估 | 2014/10/15 | 2015/05/14 | 377300 | |
| 24 | 105 | 1 | 2017 | 01 | 共同主持人 | 農業部 | 臺灣鯛種原抗逆境重要經濟性狀之良種升級開發計畫 | 2017/01/01 | 2017/12/31 | 500000 | |
| 25 | 106 | 1 | 2017 | 08 | 計畫主持人 | 其他民間企業團體-其他民間企業團體或個人 | 彰化芳苑及雲林口湖養殖戶及協會理事長訪談與近年養殖魚獲量調查計畫 | 2017/08/10 | 2017/12/31 | 130000 | |
| 26 | 106 | 1 | 2017 | 10 | 計畫主持人 | 其他民間企業團體-其他民間企業團體或個人 | 標竿體系輔導-新加坡之水產養殖產業市場現況調查 | 2017/10/02 | 2017/11/15 | 50000 | |
| 27 | 106 | 1 | 2017 | 11 | 計畫主持人 | 其他民間企業團體-政府立案法人機構 | 嘉豐海洋無用藥之全雄鯛魚種苗生產規模建立與國際合作模式、策略資料報告服務 | 2017/11/03 | 2017/12/15 | 350000 | |
| 28 | 106 | 1 | 2018 | 01 | 共同主持人 | 農業部 | 臺灣鯛種原抗逆境重要經濟性狀之良種升級開發 | 2018/01/01 | 2018/12/31 | 1000000 | |
| 29 | 106 | 2 | 2018 | 06 | 計畫主持人 | 其他政府機關-其他政府基金(如國立大學) | 建立台灣獨有海水台灣鯛種源基因庫 | 2018/06/01 | 2018/12/31 | 300000 | |
| 30 | 106 | 2 | 2018 | 06 | 計畫主持人 | 其他政府機關-其他政府基金(如國立大學) | 建立台灣獨有海水台灣鯛種原基因庫 | 2018/06/15 | 2018/12/31 | 300000 | |
| 31 | 108 | 1 | 2019 | 01 | 共同主持人 | 農業部 | 基因體標記輔助臺灣鯛抗逆良種選拔與品系培育技術開發應用 | 2019/01/01 | 2019/12/31 | 1000000 | |
| 32 | 109 | 1 | 2020 | 01 | 共同主持人 | 農業部 | 基因體標記輔助臺灣鯛抗逆良種選拔與品系培育技術開發應用 | 2020/01/01 | 2020/12/31 | 4095000 | |
| 33 | 109 | 1 | 2021 | 01 | 計畫主持人 | 農業部漁業署 | 111年度台灣鯛產銷預警計畫 | 2021/01/01 | 2024/12/31 | 550000 | |